藻类表型分析技术应用案例二
表型（phenotype）是基因组（genome）和环境(environment)共同作用的结果，近年来，随着高通量测序技术的快速发展，基因组的研究更加简单快速，然而由于植物表型本身的复杂性以及动态变化的特性，表型研究滞后于基因组研究[1]。目前表型研究主要集中在植物/作物领域，在藻类领域，表型组学研究刚刚起步，但发展速度极为迅猛。
藻类表型组学需要全面分析藻类的表型特征，尤其是光合生理、形态、颜色、色素组成与分布、不同色素的光合贡献、胁迫生理等方面的测量与分析，使藻类表型数字化、生理生态及功能可视化，这就需要针对藻类表型专门设计的技术解决方案。
易科泰为中国海洋大学设计的模块式藻类表型分析系统
表型易受外界环境(environment)影响，相同细胞、组织和个体在不同环境下均存在着差异[2]。衣藻常见的培养方式是液体培养基和光照培养，然而在琼脂板和黑暗环境下衣藻也可以生长[3]，科学家们为了研究不同培养环境下衣藻的基因表达，根据培养基状态和光照条件设计了正交实验，mc 1000多通道藻类培养与在线监测系统具备同时单独控制8组实验的环境条件，成为了此研究的*，其研究成果发表于《plos one》。
bogaert，2018
光合作用是光合生理研究的热点，叶绿素荧光测量技术作为植物光合作用研究的探针[4]，目前已涵盖细胞亚细胞水平、个体乃至群落水平，是表型研究的有力工具。烟台大学的研究者，在《environmental science and pollution research》发表了“氮源和n/p对入侵强壮硬毛藻（chaetomorpha valida）生长和光合作用的影响[5]”，研究人员使用aquapen手持式叶绿素荧光测量仪测量了fv/fm，为防治强壮硬毛藻入侵提供可行性方法。
chen，2020
生物和非生物胁迫可导致产量和品质下降，是表型研究的重要方向[6]，中国海洋大学研究者使用fluorcam多光谱荧光成像系统研究条斑紫菜（pyropia yezoensis）感染赤腐病后的次生代谢响应，为揭示藻类抗逆适应机理、培育高质量藻种提供理论依据[7]。
tang l，2019
易科泰提供藻类表型分析全面技术方案:
lfmt150/mc1000/et-psi藻类培养与在线监测
laquapen/fl6000藻类叶绿素荧光测量仪
lfluorcam叶绿素荧光/多光谱荧光成像
lfkm多光谱荧光动态显微成像系统
lspectrapen/polypen、specim高光谱测量技术
参考文献：
[1]杨有新, et al. 植物表型组学研究进展.江西农业大学学报v.37;94.06(2015):164-171.
[2] kliebenstein, d. j. . secondary metabolites and plant/environment interactions: a view through arabidopsis thaliana tinged glasses.plant cell & environment27.6(2010):675-684.
[3] bogaert, kenny a. , et al. surprisal analysis of genome-wide transcript profiling identifies differentially expressed genes and pathways associated with four growth conditions in the microalga chlamydomonas. plos one 13.4(2018):e0195142.
[4] hai-yan, cen, et al.叶绿素荧光技术在植物表型分析的研究进展.光谱学与光谱分析38.012(2018):3773-3779.
[5] li-hong, chen , et al.effects of nitrogen source and n/p on growth and photosynthesis in the invasive marine macroalga chaetomorpha valida. environmental science and pollution research 4(2020).
[6] tardieu f, simonneau t, muller b. the physiological basis of drought tolerance in crop plants: a scenario-dependent probabilistic approach[j]. annu rev plant biol, 2018, 69(1), 733-759.
[7] tang, lei , et al. transcriptomic insights into innate immunity responding to red rot disease in red alga pyropia yezoensis.international journal of molecular ences20.5970(2019).
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bogaert，2018
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chen，2020
生物和非生物胁迫可导致产量和品质下降，是表型研究的重要方向[6]，中国海洋大学研究者使用fluorcam多光谱荧光成像系统研究条斑紫菜（pyropia yezoensis）感染赤腐病后的次生代谢响应，为揭示藻类抗逆适应机理、培育高质量藻种提供理论依据[7]。
tang l，2019
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lfkm多光谱荧光动态显微成像系统
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参考文献：
[1]杨有新, et al. 植物表型组学研究进展.江西农业大学学报v.37;94.06(2015):164-171.
[2] kliebenstein, d. j. . secondary metabolites and plant/environment interactions: a view through arabidopsis thaliana tinged glasses.plant cell & environment27.6(2010):675-684.
[3] bogaert, kenny a. , et al. surprisal analysis of genome-wide transcript profiling identifies differentially expressed genes and pathways associated with four growth conditions in the microalga chlamydomonas. plos one 13.4(2018):e0195142.
[4] hai-yan, cen, et al.叶绿素荧光技术在植物表型分析的研究进展.光谱学与光谱分析38.012(2018):3773-3779.
[5] li-hong, chen , et al.effects of nitrogen source and n/p on growth and photosynthesis in the invasive marine macroalga chaetomorpha valida. environmental science and pollution research 4(2020).
[6] tardieu f, simonneau t, muller b. the physiological basis of drought tolerance in crop plants: a scenario-dependent probabilistic approach[j]. annu rev plant biol, 2018, 69(1), 733-759.
[7] tang, lei , et al. transcriptomic insights into innate immunity responding to red rot disease in red alga pyropia yezoensis.international journal of molecular ences20.5970(2019).
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