什么是全血基因组dna提取?利用明胶的吸附作用,使红细胞沉降在管底与白细胞分离。通过sds的破膜作用,使白细胞释放出dna,然后利用酚和氯仿抽提纯化,分离除去蛋白质,后用乙醇沉淀吸出dna。*采用可以特异性结合dna的离心吸附柱和*的缓冲液系统,提取全血基因组dna。 离心吸附柱中采用的硅基质材料为本公司*新型材料,能够、专一吸附dna,可大限度去除杂质蛋白及细胞中其他有机化合物。
*的操作步骤
1、样品的处理(本产品适用于处理新鲜的或已经添加抗凝剂的0.lml-1ml血液样品):
a、在血液样品中加入2-3倍体积的红细胞裂解液,充分颠倒混匀,12000rpm离心1min,小心吸去上清,沉淀应为白色或淡红色,如果裂解不*,可重复以上述步骤一次。向沉淀中加200ul溶液ya,振荡至*混匀。
b、 如果处理的血样为禽类、鸟类、两栖类或更低级生物的血液,其红细胞为有核细胞,因此处理量为5-20u1,不需要再用红细胞裂解液处理,直接加200ul溶液ya,振荡至*混匀。
2、向悬浮液中加入20ul 的rnase a (10mg/ml),充分颠倒混匀,室温放置10min。
3、加入20ul的蛋白酶k( 10mg /ml ),充分颠倒混匀,65℃水浴消化30-60min,消化期间可颠倒离心管混匀数次,直至样品消化*为止。
4、加入200ul溶液yb,再加入200ul无水乙醇,充分颠倒混匀,此时可能会出现絮状沉淀,不影响dna的提取,可将溶液和絮状沉淀都加入吸附柱中,室温放置2min。
5、12000rpm离心2min,弃废液,将吸附柱放入收集管中。
6、向吸附柱中加入600ul漂洗液(使用前请先检查是否已加入无水乙醇),12000rpm离心1min,弃废液,将吸附柱放入收集管中。
7、向吸附柱中加入600ul漂洗液,12000rpm离心1min,弃废液,将吸附柱放入收集管中。
8、12000rpm离心2min,将吸附柱敞口置于室温或50℃温箱放置数分钟,目的是将吸附柱中残余的漂洗液去除,否则漂洗液中的乙醇会影响后续的实验如酶切、pcr等。
9、将吸附柱放入一个干净的离心管中,向吸附膜*悬空滴加50-200ul经65℃水浴预热的洗脱液,室温放置5min,12000rpm离心1min。
10、离心所得洗脱液可再加入吸附柱中,12000rpm离心2min,即可得到高质量的基因组dna。
使用*注意事项
1、本试剂盒置于室温( 15 -25℃) 干燥条件下可保存12个月,更长时间的保存可置于2 -8℃。
2、常用的血液抗凝剂有edta、acd和肝素等,需注意的是,如欲制备大分子量血液基因组dna,可优先考虑使用acd抗凝。一般不使用肝素抗凝,因为用肝素抗凝的血液提取的基因组dna进行pcr扩增时,有pcr扩增抑制现象。
3、样品应避免反复冻融,否则会导致提取的dna片段较小且提取量也下降。
4、如果试剂盒中的溶液出现沉淀,可在65℃水浴中重新溶解后再使用,不影响效果。
5、绝大多数哺乳动物全血中的红细胞无核,故在提取基因组dna时需去除不含dna的无核红细胞,以免影响白细胞裂解和dna释放。如果处理的血样为禽类、鸟类、两栖类或更低级生物的血液,其红细胞为有核细胞,因此处理量减少为5-20ul,不需要再用红细胞裂解液来裂解红细胞。
6、洗脱缓冲液的体积hao不少于50ul,体积过小会影响回收效率:洗脱液的ph值对洗脱效率也有影响;若需要用水做洗脱液应保证其ph值在8.0左右(可用naoh将水的ph值调至此范围),ph 值低于7.0会降低洗脱效率。
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