乙醇固定样品DNA抽提和直接PCR实验

实验概要
本实验从乙醇浸泡的鱼苗中提取dna,并利用直接pcr进行了鉴定。
实验原理
在实际的研究工作中,野外取样的地点一旦较为偏远,受条件的限制,很难保证得到的样品活体或能够快速冷冻;另外,对一些稀有物种和濒危种,鲜活样品的采集十分困难,一般为了解决这些问题,常采用乙醇和甲醛固定的方法来处理样品,再对样品dna 进行提取以及扩增。使用乙醇固定样品具有硬化,固定,脱水作用,对组织渗透迅速,特别适合组织中核酸的保存,相比于甲醛等其它固定方法,此法更简单,保存时间更长质量更好,也更加清洁无害。乙醇固定样品主要应用于水产种质资源鉴定,医院或兽医病理样品保存,法医样品保存等方面,在特定物种基因保护,生物多样性,动物分子标记,司法鉴定等方面有广泛的应用。
omega bio-tek 相应试剂盒既能够快速有效的抽提得到乙醇保存多年的样品基因组dna,又可以利用直接pcr 系统,快速的对乙醇保存样品进行pcr 鉴定,为您的研究提供最有力的工具。
实验材料
乙醇浸泡的鱼苗
实验步骤
1. e.z.n.a. tissue direct pcr kit
1) 分别取45ul at1 和5ul at2 到0.2ml pcr 管中,混合均匀。对于有较多样品需要操作的,可以先将at1 和at2 用量计算好,混合均匀后再分装到每一管中。
2) 取鱼苗一条,在at4 中浸泡约5-10min,滤纸吸干水份。
3) 将鱼苗浸没在上一步准备的at1 中56℃水浴或者pcr 仪上消化10-20min,中间可以涡旋混匀一次。
4) 消化完后的pcr 管置于90℃水浴或者pcr 仪上5min,稍微冷却后加入50ul at3 涡旋混匀。
5) 以上裂解液就可以作为pcr 的模板直接使用,pcr 体系中建议加入5ul 左右。
6) 取5ul e.z.n.a. tissue direct pcr kit 抽提得到的一条鱼苗的dna 作为模板,客户提供的引物y-30-r/f 作为引物,pcr 扩增。
7) pcr 扩增程序:
94℃ 2min;
94℃ 30s 52℃ 30s 72℃ 40s 33cycles;
72℃ 5min;
25℃ forever。
2. e.z.n.a.? microelute? genomic dna kit
1) 称量10mg 组织,加入200ul buffer tl;
2) 加20ul ob,55℃孵化至wan全降解;
3) 13,000xg 离心2min,转移上清至新管;
4) 加220ul buffer bl 涡旋混匀,70℃孵化10min;
5) 加220ul 无水乙醇,最大速度涡旋15s;
6) 将混合液过柱吸附,13,000xg 离心30-60s,弃滤液;
7) 加500ul buffer hb,离心;
8) 700ul dnawash buffer(加乙醇);
9) 13,000xg 离心2min,干燥柱子;
10) 加25ul 70℃预热的elution buffer 洗脱。

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