实时荧光定量pcr,利用荧光信号积累实时监测整个pcr进程,最后通过标准曲线对未知模板进行定量分析的方法。常见的荧光定量pcr检测方法有sybr green i荧光嵌合法和荧光探针法。
sybr green i荧光嵌合法:
sybr green i 是一种能与双链 dna 结合发光的荧光染料。其与双链 dna 结合后, 荧光大大增强。因此, sybr green i 的荧光信号强度与双链 dna 的数量相关,可以根据荧光信号检测出 pcr 体系存在的双链 dna 数量。sybr green i 的最大吸收波长约为 497nm,发射波长最大约为 520nm。pcr 扩增程序一般为 94℃~55℃~72℃三步法,40 个循环。sybr green i 的缺点:由于 sybr green i 没有特异性,不能识别特定的双链,只要是双链就会结合发光,对 pcr 反应中的非特异性扩增或引物二聚体也会产生荧光,通常本底较高,所以在临床上使用可能会有假阳性发生。
sybr green i 的优点:sybr green i 的优点是因为其缺点产生,由于它能所有的双链dna相结合,所以对不同模板不需特别定制不同的特异性探针,通用性较好,并且价格相对较低。这对科研是很有利的,因此国内外在科研中使用比较普遍。
荧光探针法:
探针法通常是使用5’端带有荧光物质(如:fam等),3’端带有淬灭物质(如:tamra、eclipse、bhq等)的探针进行荧光检测的方法。当探针完整时,5’端的荧光物质受到3’端的淬灭物质的制约,不能检出荧光。探针的报告基团的发射波长要在淬灭基团的吸收波长范围内。
能用于实时荧光 pcr 定量的方法很多,各有优缺点,必须根据具体的实验用途进行选择。如果用于区别同源性高的序列以及进行snp分型解析等多重pcr检测,推荐用荧光探针法,而进行除此之外的real time pcr实验,我们推荐使用简单易行、成本低的sybr green i荧光嵌合法。
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