适用于血浆样本的微量文库构建试剂盒*
高品质的游离dna (cell free dna) ngs文库构建
thruplex®plasma-seq ki
· 专为cfdna设计：经过优化的修复及连接试剂
· 高品质ngs文库：高的文库多样性，在宽广的gc含量范围内，可以达到高检测再现性
· 起始量范围广：＜1 ng到30 ng cfdna量
· 快速简便：1个反应管、2小时、3步反应的简单操作，无需纯化或样品转移步骤
· 应用领域：液态活检、ctdna、目标区域测序等领域文库构建
· 兼容自动化平台：beckman fxp workstation
■ 产品说明：
thruplex plasma-seq kit基于thruplex技术，并用于血浆来源cfdna高品质ngs文库构建。该试剂已针对cfdna进行了专门优化，在保持样本gc代表性的基础上，尽可能的提升了文库的复杂度。文库可用于cnv分析、全基因组测序分析或是采用一些panel针对目标区域进行捕获富集后的dna分析,如agilent sureselect and roche nimblegen seqcap ez。
thruplex plasma-seq kit不包含index。兼容的 index如下所述，需要单独购买。
使用 thruplex plasma-seq试剂盒制备的文库，提供了更高的灵敏度，可以更好地了解血浆样本中基因变异结果。与其它液态活检的样品一样，血浆由于其易获得、价值高的特点，在某些研究领域，如对肿瘤学的转化研究或者对孕妇血浆中胎儿游离dna的发育学研究，深受科研工作者的重视。
图1. thruplex®技术概要。thruplex plasma-seq kit技术3步反应即可完成针对cell free dna的建库工作。1~30 ng含量的cf dna首先高效的进行末端修复。通过采用茎环形接头（无单链尾巴）进行高效平端连接，降低了背景。封闭的5’端阻止了接头-接头二聚体形成。随后未使用的接头被降解，进一步降低背景。高保真度扩增的方式完成以上反应，并获得含有illumina index的文库。
（*图片来源于takara bio usa,inc.）
图2. 高cfdna文库多样性、更少的unmapped reads。thruplex plasma-seq kit构建的文库，具有高的多样性和低的duplicates和unmapped reads。图中表示cfdna分别提取于3份血浆样品，文库定量采用qubit荧光定量。bioanalyzer测定mononucleosomal dna在各样品的量分别为0.09 ng、0.62 ng、15.44 ng。pooled libraries采用illumina nextseq 500 paired end模式测序，且每个文库产生17 m到25 m reads。每个文库在down-sampling数据至17 m reads以后，计算duplication rates。
（*图片来源于takara bio usa,inc.）
图3. 优异的靶向测序文库构建能力。图中所示thruplex plasma-seq kit构建的文库通过panel进行高效捕获，对kinome进行深度测序分析以检测突变。3个血浆样品分别起始建库量为5 ng、6.5 ng、10 ng，三次重复。目标区域采用sureselectxt2的clearseq human dna kinome panel进行捕获，并用illumina miseq平台进行测序，平均每个文库获得5 m reads，目标碱基被成功捕获分析。
（*图片来源于takara bio usa,inc.）
图4. 高重复性的、无偏倚的gc覆盖度。针对人类基因组，thruplex plasma-seq kit表现出高再现性、低偏倚gc覆盖度ngs文库构建能力。9次独立的血浆样品文库构建的实验结果表明，thruplex重复性高于其它产品。文库的制备是利用的1 ml血浆来源cfdna，后续采用illumina nextseq 500进行测序。作为对比，a公司试剂构建了4份独立血浆样品的文库。
（*图片来源于takara bio usa,inc.）
图5. karolinska协会和cruk测试的结果。5 ng游离cf dna采用thruplex plasma seq kit进行illumina文库构建。结果表明利用hiseq平台进行的low-pass wgs,每个文库能获得接近12.5 m reads。
（*以上数据来源于karolinska 协会，瑞典）
■ 产品组成
· template preparation buffer（red）· template preparation enzyme（red）· library synthesis buffer（yellow）· library synthesis enzyme（yellow）· library amplification buffer（green）· library amplification enzyme（green）· nuclease-free water（clear）· indexing reagents（blue）· quick protocol（n/a）
■ 保存
－20℃
dna ht dual index kits
dna ht dual index kits是与 thruplex或 picoplex文库制备试剂盒搭配使用，用以构建illumina测序文库的index引物试剂盒。这些试剂盒包含illumina nextera®xt v2 index序列对应的index引物，多可提供384种不同的双端index，用于样本混合测序时的区分。其中index引物预先分装在4个不同条形码标记的index微孔板中，每个微孔板可提供不同的96种index组合（code no.r400660-r400663），index微孔板（96n sets a-d）的每个孔提供的量足够进行一次测序反应；另一种是一套中有24个单独的反应管，每个反应管中包含不同的双端index组合（code no.r400664），且每个反应管（24n）提供的量足够进行两次测序反应。
dna unique dual index kits
dna unique dual index kits是与 thruplex或 picoplex文库制备试剂盒搭配使用，用以构建illumina测序文库的index引物试剂盒。这些试剂盒包含“idt for illumina ud”对应的index引物，多可提供96种不同双端index，用于样本混合测序时的区分。index引物预先分装在不同的4组各24个单独的管中，其中每组可提供24种不同index引物组合（code no.r400665-r400668）。每个index引物管（24u sets a-d）提供的量足够进行两次测序反应。
dna single index kits
dna single index kits是与 thruplex或 picoplex文库制备试剂盒搭配使用，用以构建illumina测序文库的index引物试剂盒。这些试剂盒包含与“truseq lt set a”序列对应的index引物，可提供24种单端index，用于样本混合测序时的区分。index引物预先分装在不同的2组各12个单独的管中，其中每组可提供12种不同index引物组合（code no.r400695和r400697）。每个index引物管（12u sets a-b）提供的量足够进行8次测序反应。
图1. thruplex®技术概要。thruplex plasma-seq kit技术3步反应即可完成针对cell free dna的建库工作。1~30 ng含量的cf dna首先高效的进行末端修复。通过采用茎环形接头（无单链尾巴）进行高效平端连接，降低了背景。封闭的5’端阻止了接头-接头二聚体形成。随后未使用的接头被降解，进一步降低背景。高保真度扩增的方式完成以上反应，并获得含有illumina index的文库。
（*图片来源于takara bio usa,inc.）
图2. 高cfdna文库多样性、更少的unmapped reads。thruplex plasma-seq kit构建的文库，具有高的多样性和低的duplicates和unmapped reads。图中表示cfdna分别提取于3份血浆样品，文库定量采用qubit荧光定量。bioanalyzer测定mononucleosomal dna在各样品的量分别为0.09 ng、0.62 ng、15.44 ng。pooled libraries采用illumina nextseq 500 paired end模式测序，且每个文库产生17 m到25 m reads。每个文库在down-sampling数据至17 m reads以后，计算duplication rates。
（*图片来源于takara bio usa,inc.）
图3. 优异的靶向测序文库构建能力。图中所示thruplex plasma-seq kit构建的文库通过panel进行高效捕获，对kinome进行深度测序分析以检测突变。3个血浆样品分别起始建库量为5 ng、6.5 ng、10 ng，三次重复。目标区域采用sureselectxt2的clearseq human dna kinome panel进行捕获，并用illumina miseq平台进行测序，平均每个文库获得5 m reads，目标碱基被成功捕获分析。
（*图片来源于takara bio usa,inc.）
图4. 高重复性的、无偏倚的gc覆盖度。针对人类基因组，thruplex plasma-seq kit表现出高再现性、低偏倚gc覆盖度ngs文库构建能力。9次独立的血浆样品文库构建的实验结果表明，thruplex重复性高于其它产品。文库的制备是利用的1 ml血浆来源cfdna，后续采用illumina nextseq 500进行测序。作为对比，a公司试剂构建了4份独立血浆样品的文库。
（*图片来源于takara bio usa,inc.）
图5. karolinska协会和cruk测试的结果。5 ng游离cf dna采用thruplex plasma seq kit进行illumina文库构建。结果表明利用hiseq平台进行的low-pass wgs,每个文库能获得接近12.5 m reads。
（*以上数据来源于karolinska 协会，瑞典）
■ 产品组成
· template preparation buffer（red）· template preparation enzyme（red）· library synthesis buffer（yellow）· library synthesis enzyme（yellow）· library amplification buffer（green）· library amplification enzyme（green）· nuclease-free water（clear）· indexing reagents（blue）· quick protocol（n/a）
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上海华雅思创生物科技有限公司主营：生物技术产品的销售与技术服务、生物新技术新产品展示、生命科学领域项目合作服务、品牌策划与品牌形象广告宣传、生物医药行业人才咨询服务、生物医药行业管理咨询服务。以“传递科学价值，服务科学研究”为宗旨，经过近十年的努力，上海华雅思创生物科技有限公司在全中国代理的干细胞产品已经成功销往：上海市、北京市、重庆市、天津市、广东省的广州市、深圳市、珠海市、江西省的南昌市、四川省的成都市、绵阳、浙江省的杭州市、宁波、温州、江苏省的南京市、苏州、无锡、泰州、湖南省的长沙、陕西省的西安市、杨凌、甘肃省的兰州、宁夏的银川、新疆的乌鲁木齐、广西省的南宁市、山东省的济南、青岛、东北三省 辽宁省的沈阳市、大连市、吉林省的长春市、黑龙江省的哈尔滨市、海南省三亚等中国绝大部分省市和自治区。
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更多takara*代理产品，欢迎关注公众号：华雅思创生物！
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两箱吊篮式冷热冲击试验箱/高低温冲击试验箱广泛应用于小型零部件产品测试
土壤状况不容乐观 监测仪器前景无限
表面振动压实仪工作原理及维护
冷鲜肉锁鲜装气调包装机充什么气体
适用于血浆样本的微量文库构建试剂盒*
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（*图片来源于takara bio usa,inc.）
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（*图片来源于takara bio usa,inc.）
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