构建带有UMT的Illumina NGS文库

构建带有umt(unique molecular tags)的illumina ngs文库
thruplex®tag-seq kit
·可信赖的实验结果。thruplex tag-seq 技术提供了多达1,600万个分子标签来纠正测序误差,
提供可信的变异检测分析。
·发现更多,成本更低。结合基于杂交技术的目标序列富集系统可分析数百个基因,同时分析突变和结构变异。
·每次都可获得高质量文库。单管操作,2小时,3步操作流程。使用简便,可减少使用者操作误差和污染发生。
·省时的生物信息学分析方案。采用curio genomics提供的云服务软件或开源软件可以快速获得
研究结果。
· 珍贵样品分析成为可能。更低的dna起始量,以往由于起始量太低而不能分析的样品也可以分析了。
thruplex tag-seq可以1 ng至50 ng cfdna或片段化的dsdna起始,兼容多种样品类型。
■ 产品说明:
thruplex tag-seq采用带有特别分子标签(umt)的thruplex引物构建带有分子标记和样品检索引物的illumina ngs文库。每个试剂盒包含超过1,600万个特别序列用于在扩增前标记每条dna小片段,可以在文库制备、目标富集和数据分析过程中追踪dna小片段,以检测低丰度等位基因或计数独立片段。采用thruplex 技术设计及优化,可以1到50 ng dna起始构建高多样性、高重复性文库。整个流程在单管或单孔中就可完成,只需3步,2小时,无需中间纯化步骤和样品转移,避免了操作误差和样品损失。thruplex tag-seq kit 包含所需全部试剂,包括可以多重标记96个样品的检索引物。纯化和定量后,文库可以采用标准illumina测序试剂和流程在illumina ngs平台进行测序。
图1. 单管,三步操作流程。 thruplex tag-seq kit以1-50 ng dna起始构建检索引物文库只需3步:末端修复,接头连接和高保真文库扩增。无需纯化和样品转移步骤。简化的工作流程,在单管或单孔中2个小时即可完成,避免样品损失,增强了阳性识别。
图2. thruplex dna-seq kit技术概要。thruplex技术以片段化双链dna或游离dna起始,只需3步反应,简单高效。
图3. 减少背景,结果更可靠。以30 ng 1% horizon cfdna standard,采用 thruplex tag-seq构建文库。agilent sureselect富集目标区域,~5,000x覆盖度测序,采用curio genomics生物信息学平台分析数据。采用原始数据分析,egfr 的突变(黄色点)会被背景误差遮盖(左图)。而在数据分析过程中使用umt修正误差,突变更容易识别(右图)。
图4. 显著提高信噪比,发现更多。以30 ng(a)或10 ng horizon cfdna standard采用thruplex tag-seq构建文库,240 kb定制panel(nimblegen seqcapez)富集目标区域,hiseq 2500 ~5,000x覆盖度测序。curio genomics生物信息学分析平台进行数据分析。
*数据来源于takara bio inc.
■ 产品组成
· template preparation buffer (red)
· template preparation enzyme (red)
· library synthesis buffer (yellow)
· library synthesis enzyme (yellow)
· library amplification buffer(green)
· library amplification enzyme(green)
· nuclease-free water(clear)
· indexing reagent
■ 保存
-20℃
订购信息
品牌 货号 产品名称 产品规
takara r400584 thruplex tag-seq 6s(12)kit 12 rxns
takara r400585 thruplex tag-seq 48s kit 48 rxns
takara r400586 thruplex tag-seq 96d kit 96 rxns
更多takara*产品,欢迎咨询,关注公众号:华雅思创生物

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